先天性心臟病室間隔缺損的生存期尚不清楚，這與其損傷的嚴重程度和處理方法有關。間質缺損比較輕微，只要及時進行手術，基本不會對生命造成任何的損害，其生存期與正常人相當。如果出現嚴重的房間隔缺損，通過外科手術，患者的心臟機能可以恢復正常，但生存期要比普通人短一些。如果不及時有效地處理，可能導致心內膜炎等并發癥，對兒童的生命和壽命造成極大的危害。