從解剖角度講，根據食管經過身體的不同區域，可將其分為三段，分別是頸段、胸段和腹段，主要是不同區域所屬的醫學科別有不同。
1、頸段：比較短，頸段長約5cm，自食管起始段至胸廓入口，其后壁靠脊柱，前壁貼著氣管，內鏡檢查距離門齒15-20cm，歸屬五官科或胸外科；
2、胸段：胸段最長，約18-20cm，后壁逐漸脫離脊柱，與氣管平行走向，自胸廓入口至食管裂孔之間。胸段又分為上、中、下三段，胸上段食管自胸廓入口至奇靜脈弓下緣水平，胸中段自奇靜脈弓下緣至肺靜脈水平，胸下段自肺靜脈水平至食管裂孔。內鏡檢查距離門齒20-40cm，歸屬胸外科；
3、腹段：腹段最短，約1-2cm，自食管裂孔至賁門，內鏡檢查距離門齒40cm左右，歸屬胸外科或普外科。
在食管的三個分段中有著三個狹窄，分別位于食管起始部、左支氣管交叉處和膈的食管裂孔處。這三處位置相對狹窄，是異物容易滯留的部位，也是食管癌的好發部位。若出現疾病，患者會表現出反流、吞咽困難、胸骨后疼痛、燒灼感等，通常以胃鏡檢查為主，可觀察食道是否有占位性病變，也可取病理組織進行活檢以明確診斷。