大蒜素對病毒一般沒有效，但是對細菌、真菌等病原體有效。
在日常生活中，大蒜素存在于大蒜內，吃了可以起到一定抗菌消炎、增強免疫力的作用。在臨床上，大蒜素是一種原料藥，包括大蒜素膠囊、大蒜素膠囊、大蒜素注射液等劑型，主要用于深部真菌和細菌感染。但是大蒜素對病毒的效果一般不明顯，不能殺滅病毒。
大蒜素及其相關藥品，一般可防治急慢性菌痢和腸炎、百日咳、肺部和消化道真菌感染、新型隱球菌性腦膜炎、肺結核等病癥。大蒜素中的氧原子與細菌生長、繁殖所必需的半胱氨酸分子中的巰基相結合，使巰基氧化、蛋白質被滅活，同時可對真菌內的多種氨基酸起到抑制作用，就能夠起到抗菌消炎的作用。但是大蒜素對病毒沒有此類機制和作用，所以不能殺滅和滅活病毒。
病毒的類型比較多，感染后需要根據具體的病毒類型選擇適合的藥物治療，精準地殺滅病毒，病情才能更快地好轉。例如皰疹病毒感染，患者容易出現皮膚瘙癢、針刺感或者發熱、頭痛、乏力等癥狀，可遵醫囑使用阿昔洛韋軟膏、噴昔洛韋乳膏等藥物進行治療，都屬于抗病毒藥物。服藥期間注意清淡飲食，保證作息規律、睡眠充足、心情愉悅。