靈芝孢子粉副作用可能有過敏反應、胃腸道不適、凝血功能障礙、加重肝腎負擔、影響神經系統等，禁忌主要包括過敏體質者、脾胃功能差者、糖尿病患者、孕婦、兒童等人群，并且其應在醫生指導下使用。
一、副作用
1、過敏反應：靈芝孢子粉可能含有過敏成分，服用期間可能會出現過敏反應，輕者可能出現皮膚瘙癢、發紅等現象，重者可能會出現過敏性休克或過敏性腦炎。
2、胃腸道不適：如果個人胃腸道功能較弱，靈芝孢子粉可能會對胃黏膜產生刺激，從而導致惡心、嘔吐、腹瀉等癥狀的發生。
3、凝血功能障礙：靈芝孢子粉具有活血的效果，可以促進人體血液循環，影響凝血功能，延長凝血時間。如果有傷口存在，服用靈芝孢子粉會使其凝血功能出現障礙，影響其愈合。
4、加重肝腎負擔：如果過度服用靈芝孢子粉，可能會增加肝腎的代謝負擔，從而損傷肝腎功能，不利于身體健康。
5、影響神經系統：靈芝孢子粉能夠刺激人體的中樞神經，使人興奮和活躍。應避免晚上服用，因為其可能會刺激神經系統，出現入睡困難。
二、禁忌
1、過敏體質者：過敏體質的人服用靈芝孢子粉后，可能會出現過敏反應，如皮疹、喉頭水腫等，嚴重者甚至可能出現呼吸困難等癥狀。
2、脾胃功能差者：靈芝孢子粉對胃腸道有一定的刺激作用，脾胃功能差者需要避免服用，以免增加胃腸道負擔。
3、糖尿病患者：靈芝孢子粉中含有大量的多糖類物質，可能會增加血糖水平，不利于控制血糖，所以糖尿病患者也不宜服用。
4、孕婦：孕婦屬于特殊群體，其體質較敏感，靈芝孢子粉膠中含有真菌干燥子實體，孕婦服用后可能會出現過敏現象，還容易導致腹瀉，為避免影響孕婦健康或導致胎兒畸形甚至流產，應謹慎使用。
5、兒童：兒童的免疫系統尚未完全發育成熟，服用靈芝孢子粉可能會影響其正常發育。因此，兒童應禁用靈芝孢子粉。
服用靈芝孢子粉期間，還應注意避免與辛辣刺激性食物同食，如花椒、辣椒、芥末等，以免影響其治療效果。