睡覺時流口水很臭需要針對原因進行治療，可以分為生理性原因和病理性原因，生理性原因一般無需特殊治療，病理性原因主要是口腔炎癥與胃腸道疾病導致，需要根據其他臨床表現以及輔助檢查綜合判斷，診斷明確后進行針對性治療。
一、生理性原因：健康人睡覺時可能由于姿勢不當，口腔肌肉不受控制，口水會不自覺流出，由于口腔內有細菌，帶有一定的臭味，屬于正常的生理現象，無需特殊治療。日常生活中需要注意口腔衛生，盡量保持飲食清淡，睡覺時盡量不采用俯臥睡姿，可適當抬高枕頭。
二、病理性原因：1、口腔炎癥：在各種因素影響下口腔中發生細菌感染，導致口腔中某個部位產生炎癥，比如牙齦炎、牙周炎等。由于炎癥的刺激唾液分泌增多，細菌繁殖產生臭味，一般還伴有炎癥部位疼痛、腫脹。治療時需要遵醫囑使用抗厭氧菌的抗生素，如甲硝唑、替硝唑等，治療原發疾病，病情好轉后睡覺流口水很臭的現象也會逐漸減輕；
2、胃腸道疾病：一些胃腸道疾病可能出現睡覺時流口水很臭，比如存在幽門螺桿菌感染，常伴有腹痛、腹脹、腹瀉等消化道癥狀。可以使用抑制胃酸的藥物治療，如奧美拉唑、蘭索拉唑等，還可配合胃腸促動藥，如在醫生指導下聯合使用多潘立酮、莫沙必利等；
3、其他原因：如果患者合并前牙畸形、神經調節障礙等疾病，可能導致睡覺流口水，在合并其他因素時出現睡覺流口水很臭的癥狀。這時前牙畸形可通過矯正牙齒緩解，神經調節障礙一般無需藥物治療，保持日常規律作息，避免過度疲勞或各種不良刺激即可。