核酸假陰性是指受檢者存在病毒感染，但是核酸檢測的結果表現為陰性，可能與多方面因素有關，比如處于發病早期階段、標本采集不規范以及存在檢測誤差等。
1、處于發病早期階段：核酸檢測的主要目的是排查標本當中是否存在病毒，如果病毒含量比較高，核酸檢測可能會出現陽性的結果，而病毒含量比較低或沒有病毒存在時，核酸檢測通常會出現陰性的結果。因此，如果處于發病早期階段，體內的病毒含量相對較低，此時由于取到的標本病毒數量不足，可能會出現核酸假陰性的現象；
2、標本采集不規范：核酸檢測需要留取咽拭子、鼻咽拭子等標本進行檢查，如果留取標本的過程不規范，相對來講取到的病毒也會比較少，此時同樣可能會出現核酸假陰性；
3、存在檢測誤差：核酸檢測結果還可能會受到檢測過程的影響，如果檢測過程中受到干擾，出現檢測誤差，也可能會存在核酸假陰性的情況。