智齒長出來頂到肉痛建議進行一般治療、藥物治療、手術治療等。
1、一般治療：如果是長在下頜處的智齒，由于下頜有很厚的皮質，智齒在萌出的過程中，所受到的阻力比較大，可能會引起局部發癢、疼痛。若是沒有引起發炎，注意在智齒完全萌出之前避免長時間咀嚼口香糖、檳榔等，避免吃核桃、炸花生、碧根果等過于堅硬的食物，以免影響智齒萌出即可，待智齒完全萌出后，疼痛癥狀通常會自行緩解。
2、藥物治療：如果智齒萌出不順利，導致周圍牙齦出現紅腫、灼熱、疼痛、化膿等癥狀，說明局部存在感染，可能已經引起冠周炎。患者通常需要按醫囑進行藥物治療，比如布洛芬緩釋膠囊、鹽酸米諾環素膠囊、人工牛黃甲硝唑膠囊等。
3、手術治療：若是冠周炎導致的，而且藥物治療效果不好，牙齦周圍出現膿腫，患者一般需要進行齦瓣切除術、切開引流術等手術進行治療；但如果是因智齒生長方向異常，為水平阻生、倒置阻生等類型的智齒，則需要進行拔牙術。
另外，患者需要注意保持口腔衛生，飯后勤刷牙，以免食物殘渣堆積，造成細菌滋生。