肛門里面瘢痕常年隱痛可能和神經恢復、肛周感染、肛周膿腫有關。神經恢復引起的疼痛可以使用他克莫司軟膏局部涂抹治療，肛周感染可以口服頭孢呋辛酯片治療，肛周膿腫可以使用硫酸依替米星治療。具體情況如下：
1、神經恢復：患者進行肛周手術早期愈合后，形成的瘢痕較硬。瘢痕成熟期的正常過程，通常會有針刺樣的疼痛、瘙癢、肛門下墜，或者排便時有灼燒感等癥狀，通常是神經恢復的表現，切口越大癥狀越明顯。患者可以使用他克莫司軟膏局部涂抹治療，同時可以溫水坐浴或者理療促進瘢痕軟化。
2、肛周感染：肛門里面瘢痕常年隱痛有可能是肛周感染，肛門排便后未及時清潔，肛門口容易受到大便的污染，從而出現肛周感染。患者可以口服頭孢呋辛酯片、頭孢克肟膠囊，或使用高錳酸鉀坐浴治療，同時避免食用辛辣刺激性的食物。
3、肛周膿腫：肛門、肛管和直腸周圍的急性化膿感染性疾病，肛門直腸手術引起的直腸周圍膿腫，表現為肛周持續性劇烈疼痛呈逐漸加重等，所以患者肛門里面瘢痕常年隱痛可能與肛周膿腫有關。患者可以使用硫酸依替米星、硫酸卡那霉素、硫酸鏈霉素等藥物治療，同時盡量少坐多站，避免便秘。