小女孩短褲上有褐色分泌物，通常是由月經初潮、尿道炎、腸道感染、陰道炎、處女膜閉鎖等引起的，需要及時就醫，針對病因進行治療。
1.月經初潮：月經初潮的年齡通常在11到19歲，由于卵巢性腺軸沒有發育完全，子宮內膜會進行脫落，可能導致內褲上有褐色分泌物。這是正常生理現象，無需進行特殊治療。家長應告知孩子衛生巾等用品的正確使用，并強調經期衛生和保暖的重要性。
2.尿道炎：一個小女孩的免疫系統可能會減弱，這可能導致尿道感染。如果不小心感染了細菌，可能會觸發尿道的炎癥反應。由于炎癥因子的刺激，可能會在排尿時感到尿道刺痛、腫脹，通常會有輕微的出血。在進行抗感染治療時，也可以考慮使用阿莫西林膠囊和左氧氟沙星注射液等抗生素藥物。
3.腸道感染：如果患有細菌性痢疾或其他腸道感染性疾病，這可能會導致腸道黏膜的糜爛和出血，從而引發肛門出血，通常還會伴隨著腹部疼痛。通常，可以考慮使用鹽酸左氧氟沙星注射液或硫酸阿米卡星注射液等抗生素進行治療，但使用這些藥物可能會導致皮疹、惡心等副作用。
4.陰道炎：如果小女孩在日常生活中忽視了陰部的保養，可能會患上陰道炎。炎癥因子可能會刺激陰道黏膜，導致生殖器腫脹，并可能出現異味、白帶帶有血絲等癥狀。建議遵醫囑使用注射用頭孢曲松鈉和注射用頭孢噻肟等抗感染藥物，可能會導致一系列不良反應，包括頭暈、惡心、嘔吐、皮炎和瘙癢等。
5.處女膜閉鎖：處女膜閉鎖是一種先天性的生殖道畸形，可能導致經血排出不暢，積聚在陰道內再經氧化后形成褐色分泌物。帶小女孩就醫，進行詳細的婦科檢查。如果確診為處女膜閉鎖，可能需要通過手術進行治療。
除了上述原因，盆腔炎等疾病也可能是原因之一。建議盡快前往醫院接受治療，并在醫生的專業判斷下進行治療，所有藥物的使用都必須在醫生的指導下進行。