甲硝唑氯己定洗劑用了后小便有點疼可能是因為藥物副作用、陰道炎、尿路感染等多種原因所造成的，可根據個人的病因選擇合適的調整方式。
1、藥物副作用：甲硝唑氯己定洗劑是屬于一種比較常見的婦科洗劑，主要可用于改善細菌、霉菌、滴蟲性陰道炎，還可用于改善宮頸炎和宮頸糜爛，有少數女性在使用過程中很可能會出現藥物的不良反應，主要會出現灼燒感或者是紅腫，甚至還會出現小便疼痛。如果癥狀比較嚴重，需要立刻停止用藥，并且需要將局部的藥物清洗干凈。
2、陰道炎：陰道炎在發病之后很可能會導致陰道黏膜受到刺激，導致陰道黏膜處于充血和水腫的狀態，在排尿過程中很可能會導致陰道里面出現刺激，也會出現小便疼痛，還會出現白帶分泌物增多、瘙癢、異味等。一般是可以繼續使用甲硝唑氯己定洗劑，同時還需要注意每天晚上使用溫水清洗。
3、尿路感染：尿路感染是屬于一種比較常見的泌尿系統疾病，由于炎癥刺激所引起的，通常會出現尿頻、尿急、小便疼痛。一般需要在醫生指導下使用抗生素藥物治療，比如阿莫西林膠囊和左氧氟沙星膠囊、頭孢克肟片等。