一般來說，低危型54陽性是指感染了人乳頭瘤病毒低危54型，是需要治療的，可以根據病情使用藥物、物理療法等方式進行治療。
人乳頭瘤病毒低危54型陽性容易引起外陰、陰道和宮頸的尖銳濕疣，也可能會導致宮頸鱗狀上皮病變。所以，如果做常規的宮頸癌篩查，發現感染了人乳頭瘤病毒低危54型，應該進一步做陰道鏡檢查，查看宮頸表面、陰道和外陰是否出現尖銳濕疣的癥狀。如果沒有出現尖銳濕疣的癥狀，可以進行動態觀察，注意清淡飲食，可以在醫生指導下口服抗病毒藥物進行治療，比如阿昔洛韋片、更昔洛韋片等；如果出現尖銳濕疣，建議在醫生指導下外用氟尿嘧啶軟膏、阿昔洛韋軟膏、咪喹莫特乳膏等藥物進行治療，必要時可以采取激光、液氮冷凍治療等物理療法，可以有效去除尖銳濕疣。如果檢查發現人乳頭瘤病毒低危54型引起宮頸鱗狀上皮病變，可以通過冷凍、激光、高功率聚焦超聲治療等物理療法進行治療，可以有效緩解宮頸鱗狀上皮病變的癥狀。
治療期間，患者應注意飲食調理，多食用奶類、蛋類、瘦肉等富含蛋白質的食物，也要多食用新鮮的蔬菜和水果，忌食辛辣刺激性食物。