早上起來肝區隱痛可能是生理性因素所誘發，比如過度勞累、精神壓力大，也不排除是病理性因素造成，比如慢性病毒性肝炎、膽囊炎、脂肪肝、肝硬化等。
一、生理性因素：在平時生活中患者長時間過度勞累，精神壓力過大，這樣會直接影響肝功能的代謝，從而對于自身的肝臟細胞造成一定損傷，誘發轉氨酶升高，部分患者在早晨起來的時候會出現肝區隱隱作痛的癥狀。平時應該注意休息，避免過度勞累，保持心情舒暢，不要給自己太大壓力。
二、病理性因素：1、慢性病毒性肝炎：慢性病毒性肝炎主要是患者身體受到多種不同肝炎病毒導致的一種疾病，這種疾病直接造成肝臟出現炎癥，甚至還會刺激肝臟包膜，從而誘發肝區出現疼痛，并有黃疸、乏力等癥狀，可遵醫囑服用恩替卡韋片、索磷布韋片等進行治療；
2、膽囊炎：與細菌感染、化學刺激有關，造成自身的膽囊組織出現了炎癥改變，一旦感染以后，由于膽囊與肝臟相連，可能會引發肝臟感染，造成肝區部位隱痛，并有高熱、惡心、嘔吐等癥狀，可遵醫囑服用頭孢克肟分散片、苯丙醇軟膠囊等進行治療；
3、脂肪肝：脂肪肝主要是生活中長時間吃含有脂肪較高的食物，這樣會導致患者的肝細胞脂肪變性，這些脂肪長時間堆積在肝細胞當中，會使肝細胞體積增大和肝臟組織增大，造成局部的肝被膜受到牽張，早晨起來的時候會有感覺隱隱作痛的情況，并有食欲減退、惡心的癥狀，可遵醫囑服用美他多辛片、多烯磷脂酰膽堿膠囊等進行治療；
4、肝硬化：與病毒感染、酒精、藥物等有關，肝硬化是一種慢性進行性肝病，會引起肝組織彌漫纖維化和再生結節出現，肝臟正常結構和血供遭到破壞，從而引起肝細胞受損，誘發肝區疼痛，并有輕度乏力、食欲缺乏等癥狀，可遵醫囑服用螺內酯片、呋塞米片等進行治療；
5、肝癌：肝癌的患者，如果體內的癌癥組織大量生長，會直接侵犯肝臟細胞，造成肝包膜受損和擴張，從而引起患者在早晨起來的時候就會出現疼痛，并有食欲減退、乏力等癥狀，可遵醫囑進行手術治療。
此外，肝血管瘤、帶狀皰疹、肋骨以及肋骨神經的病變、酒精性肝病、藥物性肝炎、自身免疫性肝病、膽囊結石等，都有可能引發上述癥狀，建議及時到消化內科進行B超、肝功能、肝病標志物等檢查，明確診斷。日常注意清淡飲食，不吃辛辣刺激性的食物，保證充足的睡眠時間。