寶寶支原體肺炎反復發燒可能是炎癥較重，或合并其它細菌或病毒感染，以及合并其它疾病等，需前往醫院進行檢查后明確病因。
1、炎癥較重：寶寶支原體肺炎可為輕癥，亦可為重癥。當感染較重時，并非立刻用藥即可緩解，會出現反復發燒的情況，需進行多療程的聯合治療，才能改善癥狀；
2、合并其它細菌或病毒感染：如果為混合感染，則單一的抗支原體治療，如使用阿奇霉素或紅霉素等，可能無法完全控制病情，容易出現反復發燒的情況。若抗支原體治療效果不佳，需及時檢查是否存在其他感染源，并進行聯合用藥治療。如合并有呼吸道合胞病毒、腺病毒，需給予相應的抗病毒治療，如阿昔洛韋、利巴韋林等，合并細菌感染，必要時可聯合頭孢菌素進行治療；
3、合并其它疾病：如支原體肺炎合并心肌炎、心包炎等，亦可出現反復發燒，所以需結合寶寶的具體臨床癥狀、體征，進行相關檢查后再針對性進行治療。