月經第五天肚子隱隱痛，可能是正常情況、盆腔炎、消化系統疾病、泌尿系統疾病等多種因素導致，需要根據情況采取生活調理、用藥等方法治療。
1、正常情況：月經第五天大部分子宮內膜還沒有完全修復，因此月經還沒有干凈，有少量的出血子宮會發生收縮，表現為肚子隱隱痛，屬于正常情況，可以通過多休息和熱敷等方法來緩解癥狀；
2、盆腔炎：子宮或附件組織發炎導致盆腔炎，在月經期因子宮內膜脫落和再生，內分泌水平不穩定，因此腹痛的癥狀會比較明顯，發生月經第五天肚子隱隱痛的情況，同時還會伴有分泌物增多、瘙癢等癥狀。可以應用消炎的藥物，如口服頭孢克肟膠囊、婦科千金片等來治療；
3、消化系統疾病：多見于在月經期發生腸炎、消化不良等疾病，導致腸管脹氣，因此出現肚子隱隱痛，一般通過保暖或氣體排出后癥狀能緩解，也可以應用藥物，如腸炎寧片，健胃消食片等，飲食要清淡，少吃涼的和刺激性的食物；
4、泌尿系統疾病：月經第五天如發生泌尿系感染或者結石等疾病，因膀胱或者輸尿管肌肉痙攣，容易發生肚子隱隱痛。感染可以選擇阿莫西林膠囊、阿奇霉素片等藥物消炎，結石可應用排石顆粒等藥物，如果效果不理想則需要進行體外超聲波碎石。
月經期女性要注意多休息，不能著涼和勞累，如果腹痛嚴重或時間長要及時去醫院就診。