膳食纖維本身對身體沒有壞處，因此并沒有膳食纖維三大壞處這一說法。只有在膳食纖維攝入量過大時，才可能會對身體產生危害，如引發胃腸不適、影響其他營養成分吸收以及誘發低血糖等。
1、引發胃腸不適：尤其是不可溶性的膳食纖維，不容易被人體消化、吸收，進食過多可加重胃腸道的負擔，長時間未改善還可導致消化不良等。增加胃腸蠕動的頻率，體內產氣量也隨之增加，出現頻繁排氣、腹脹等不適；
2、影響其他營養成分吸收：過量攝入膳食纖維可對胃腸蠕動、胃排空產生明顯的影響，長期如此可使其他營養成分不能被較好地吸收利用，未及時糾正還可引發部分營養素缺乏；
3、誘發低血糖：膳食纖維尤其是可溶性膳食纖維，適量攝入可在體內形成黏膠，減少小腸對碳水化合物的吸收，進而可起到一定控制血糖的作用。攝入量過大時則可能會起反作用，誘發低血糖，尤其是以往有低血糖情況的人，需要注意控制膳食纖維攝入量。
另外，存在胃腸道問題的人，如患有胃病、做過腸道手術以及老年人等，更容易出現上述不適癥狀，因此應當注意調整膳食結構，避免攝入的膳食纖維過多而產生不適。