寶寶先天性基因遺傳代謝換肝后大部分的人群并不會出現后遺癥，只有極少數的人群有可能會存在。
1、不會：先天性基因遺傳代謝可以通過換肝手術的方法來做治療，能夠達到改善肝功能，有助于延緩患者的生命，也能避免出現嚴重的并發癥。大部分的這些在治療之后并不會出現不良反應或者后遺癥，也不會對身體健康造成嚴重的影響。
2、會：先天性基因遺傳代謝，在患肝手術之后也不排除會對身體健康造成影響，可能會留下來后遺癥，比如出現神經麻痹或者是智力受到干擾等癥狀。