通常來說，不存在屎腸球菌和糞腸球菌哪個難治這種說法，都可以在醫生的指導下使用抗菌藥進行治療。具體分析如下：
屎腸球菌為圓形或橢圓形，呈單個、成對或短鏈狀排列的革蘭氏陽性球菌；糞腸球菌是一種兼性厭氧型革蘭氏陽性乳酸菌，菌體形態為球狀或鏈狀。屎腸球菌和糞腸球菌都屬于腸球菌屬，是人及動物腸道中正常菌群的一部分，二者并不存在哪個難治的這種說法，都可以使用抗菌藥進行治療。如果出現在腸道中無需治療，但是出現在腸道以外的部位，一般不屬于正常情況，說明此處被感染，需要在醫生的指導下使用左氧氟沙星片、頭孢呋辛酯片、注射用青霉素鉀、羅紅霉素片等藥物進行治療。