間位結腸并不一定都能自愈，如果病情較輕，可能數天能自愈。但是如果病情較重，則有可能無法自愈，具體情況需要由消化內科醫生結合臨床癥狀進行綜合判斷。
結腸通常在肝臟下緣，結腸過長者可移至膈肌與肝臟之間，稱為間位結腸。如果間位結腸沒有對結腸周圍器官的正常功能產生影響，也沒有出現明顯的不適癥狀，可能會在數天后由于體位變化而自愈。但是如果間位結腸比較嚴重，引起結腸擴張、結腸梗阻等并發癥，出現腹痛、腹脹、嘔吐等不適癥狀，甚至還對周圍組織造成影響，需要積極進行治療。如果治療不及時，有可能引起腸道缺血、壞死，并發腹膜炎、循環衰竭等嚴重后果，甚至會危及生命。
如果間位結腸患者出現上述不適癥狀，需要及時到醫院的消化內科或急診科就診，在醫生指導下通過手術解除結腸擴張、結腸梗阻，比如腸管內放置支架、腸切除及腸吻合術等，同時需要固定肝臟和結腸。術后應遵醫囑服用阿莫西林膠囊、頭孢克肟片等藥物預防和控制感染，同時避免進食辣椒、大蒜等辛辣刺激食物。