體內射精后服用緊急避孕藥是否會懷孕通常需要分情況來看，可能不會懷孕，也可能會懷孕。
緊急避孕藥的主要作用是通過抑制排卵、阻止受精或阻止受精卵著床來達到避孕目的。如果在無保護性生活后的72小時內，女性按照醫囑使用緊急避孕藥，避孕成功率通常較高。如果在排卵前服用，能較好地發揮抑制排卵的作用。
但如果已經排卵，且受精發生在服藥前，避孕效果就可能會受到影響。如果服藥后短時間內發生嘔吐，導致藥物吐出，未能被充分吸收，也會降低避孕效果。還有，有些女性對緊急避孕藥的反應存在個體差異，藥物在體內的代謝速度不同，也可能影響避孕效果。
女性不能將緊急避孕藥作為常規避孕方式，頻繁使用可能對身體造成不良影響。