杯狀和皰疹通常指杯狀病毒和皰疹病毒。區別主要有性質不同、癥狀不同、導致的疾病不同等。
1、性質不同：杯狀病毒是一群有典型杯狀形態的圓形、無包膜的RNA病毒的總稱。皰疹病毒是一群有包膜的DNA病毒。
2、癥狀不同：杯狀病毒感染的主要癥狀是發熱、嘔吐、惡心、腹瀉、腹痛等。皰疹病毒感染的主要癥狀是黏膜與皮膚出現皰疹，以及上呼吸道感染等。
3、導致的疾病不同：人感染杯狀病毒后主要導致急性胃腸炎。人感染皰疹病毒后可能導致的疾病較多，如咽炎、唇炎、生殖器皰疹、水痘、帶狀皰疹等。
此外，杯狀病毒和皰疹病毒的區別還有檢測方式不同、治療方式不同、預防方式不同等。