傳染病的隔離期主要根據潛伏期的長短、傳播途徑、病原體確定。隔離是指把傳染病病人或者病原攜帶者安排在指定的隔離場所，暫時性與正常健康人群隔離開來，積極進行疾病治療和護理，并且對具有傳染性的分泌、排泄物、生活用品等進行消毒、滅菌處理，以防止病原體向外界擴散，產生危害的醫療措施。
1、潛伏期的長短：潛伏期是指病原體從開始進入人體，到最早出現了臨床癥狀或者體征的時期。不同的傳染病潛伏期不同，傳染病的隔離期一般根據潛伏期的長短確定，潛伏期的長短一般和病原體進入人體的數量、毒力、繁殖力、進入途徑以及人體免疫力有關，傳染病的隔離期一般為平均潛伏期加上一兩天，危害嚴重的傳染病可按該病的最長潛伏期確定；
2、傳播途徑：病原體離開傳染源到達另一個易感者的途徑稱為傳播途徑，主要有呼吸道、消化道、接觸、蟲媒、血液、體液傳播等，不同的傳播途徑也會影響隔離期長短，比較容易接觸人的傳播途徑其隔離期會比較長，反之則會比較短；
3、病原體：傳染病的病原體主要有病毒、細菌、衣原體、支原體、真菌等，不同的病原體隔離期也不一樣，其具體時間要結合上述因素及病原體的傳播速度綜合判定。