病原體是指能導致人、動物等生物發生感染的媒介統稱，主要包括微生物和寄生蟲，其中微生物更為多見，如細菌、真菌、病毒、支原體、螺旋體等，是最常見的病原體之一。寄生蟲主要包括原蟲、蠕蟲等。
1、微生物：細菌可導致皮膚、器官等組織出現化膿性感染，如毛囊炎、肺炎、腸炎、胃炎等；病毒可引起新型冠狀病毒、SARS等感染性疾病；其他病原體如真菌、支原體、衣原體等，攻擊人體不同部位時，可引起不同的炎癥反應；
2、寄生蟲：常見如瘧疾、血吸蟲病等都是由寄生蟲感染引起的，寄生蟲通常可經水傳播 、食物、土壤、空氣飛沫、節肢動物以及人體直接傳播等途徑來進行傳播。
各類病原體可超過400種，廣泛存在于人體呼吸系統、消化系統、生殖系統等組織中，通常情況下在體內達到平衡狀態，一般不會發病。尤其是部分細菌還可對人體有益，如腸道菌群可以合成多種維生素，促進胃腸道蠕動和消化，以保證人體健康。
因此，發病通常與某一種病原體突然增多或大量繁殖，或人體免疫力下降時體內系統平衡遭到破壞有關。但少數致病微生物致病力相當強，如鼠疫耶爾森菌、天花病毒、狂犬病毒等，輕微感染亦可致病。多數病原體感染，可使用抗細菌、抗病毒類藥物，或抗生素針對致病菌的具體種類進行治療。