裝起搏器后肩胛骨肌肉萎縮可能是由于感染、手術創傷等原因引起，一般需要根據具體病因選擇合適的治療方法。
1、感染：安裝起搏器的過程中可能會造成皮膚出血，引發心內膜感染，可能會出現炎癥，侵及全身部位時，可能會導致神經纖維功能受損，從而出現肩胛骨肌肉萎縮的情況。可以在醫生的指導下服用頭孢呋辛酯片、苯唑西林鈉片等抗感染類藥物進行治療。
2、手術創傷：安裝起搏器的過程中可能會出現創傷，影響腋神經等多神經出現功能異常，引發輕度肌肉萎縮。可以在醫生的指導下服用甲鈷胺片、維生素B1片等藥物進行治療。