第一天頭痛第二天喉嚨痛可能是感冒、急性咽炎、新型冠狀病毒感染等因素引起的，需明確病因對癥進行治療。
1、感冒：該病一般是指上呼吸道感染，主要是病菌感染引起的炎癥現象，可能會損傷神經，出現發熱、頭痛等癥狀，若病癥未及時治愈，還可能會對呼吸道黏膜造成損傷，可能會出現喉嚨痛的現象。患者需在醫生指導下使用板藍根顆粒、布洛芬片、阿莫西林膠囊等藥物進行治療。
2、急性咽炎：該病是指咽喉黏膜出現的急性炎癥。炎癥因子若是浸潤到局部黏膜，可造成咽喉水腫，出現咳嗽、疼痛、咳痰等現象，受炎癥刺激一般會伴隨有發熱的癥狀。患者可在醫生指導下使用對乙酰氨基酚滴劑、頭孢克肟顆粒、川貝枇杷糖漿等藥物進行治療。
3、新型冠狀病毒感染：新型冠狀病毒感染主要是指新型冠狀病毒引起的一種呼吸系統傳染性疾病。病癥初始階段，病毒可侵犯呼吸道，出現發熱、乏力等，若是病情發展可累及呼吸道，出現咳嗽、咽痛等現象。患者可在醫生指導下使用布洛芬緩釋膠囊、連花清瘟顆粒、維C銀翹片等藥物進行治療。
除需對癥進行治療外，患者通常還需做好護理，注意根據溫度變化添減衣物，避免著涼，同時少吃辣椒、花椒等辛辣刺激的食物，減少對身體的刺激，促進患者恢復。