患者使用氟尿嘧啶去除跖疣可采取外用或注射的方法進行治療。跖疣是因感染人乳頭瘤病毒后出現的癥狀，有感染性，可發生于任意年齡段，嬰幼兒群體較少，免疫力較低下的人也易被感染。此病常直接或間接感染他人，患者可能會出現腳部出現疣體、粗糙斑塊等癥狀，部分患者可能出現疼痛，通常可在醫生指導下使用氟尿嘧啶類藥物治療。
1、外用：跖疣是因感染人乳頭瘤病毒后在足部出現增生物的病癥，常出現在腳后跟、足趾前部、足趾夾縫處，患者通常可以外用氟尿嘧啶進行治療。患者可用氟尿嘧啶軟膏涂抹患處，也可用氟尿嘧啶注射劑浸濕紗布，再用紗布外敷在患處，定期進行外敷能達到一定的治療效果。
2、注射：如果出現疣體的面積過大，外用的效果不佳，患者通常可使用注射氟尿嘧啶注射劑的方法進行治療，達到在體內殺菌的效果。但在注射的時候需去正規醫院進行，注射前要對皮膚進行消毒，注射后注意針眼護理，防止針眼處受感染。
患者如出現癥狀應去醫院做相關的皮膚鏡檢查、HPV-DNA檢查，如被確診應及時治療，跖疣常使用氟尿嘧啶類藥物進行治療，也可采用冷凍、電灼、激光等物理療法，還可采用木賊、馬齒莧、板藍根等中藥藥材泡腳進行輔助治療。日常生活中要保持患處清潔干燥，切勿抓撓，勤換鞋襪，飲食清淡，不與他人共用私人物品，避免光腳在室外或游泳池等場地走動，注意對患處進行日常監控。