一般小孩生殖器發育不良，可以掛泌尿外科、小兒泌尿外科、小兒外科或普通外科，建議到當地正規的醫院進行就診，需要進行相應的檢查，必要時可進行手術治療。
1、泌尿外科、小兒泌尿外科：小孩出現生殖器發育不良的情況，可能會有陰莖過于短小、尿道下裂、包皮過長、尿道外口狹窄等現象，多與先天性畸形、染色體異常有關。生殖器屬于泌尿系統，可以掛泌尿外科確定病因以后，進行針對性治療。部分醫院的科室劃分比較詳細，還有小兒泌尿外科，但部分醫院只有泌尿外科，兩個科室均可以就診；
2、小兒外科或普通外科：生殖器也屬于外科范疇，對于沒有小兒泌尿外科的醫院，也可以到小兒外科或普通外科檢查治療，如檢查小孩生殖器的外觀，以及生殖器本身是否存在個體差異，再選擇適合的治療方法。
此外，根據檢查的結果，可能還需要再掛其他的科室進行配合治療，如內分泌科等。日常生活中小孩需要注意局部清潔干燥，勤換洗貼身衣物，有助于維護局部衛生，以免產生感染等情況。