在體內維生素D充足的情況下，碳酸鈣的吸收率，較其他鈣劑的吸收率高，利用程度好，吸收率為39%左右。機體缺鈣會產生較多的臨床癥狀和體征，如嬰幼兒缺鈣可能發生佝僂病，易出現易驚、煩躁、枕禿等癥狀，老年人缺鈣容易發生骨質疏松。
若體內的維生素D充足，碳酸鈣的吸收率為39%，乳酸鈣吸收率為32%，醋酸鈣吸收率為32%，檸檬酸鈣吸收率為30%，葡萄糖酸鈣吸收率為27%。由此看來，碳酸鈣的吸收率相對較高。維生素D能夠幫助腸道的鈣吸收入血，血中的鈣再沉積到骨骼上。部分人如果單純吃碳酸鈣，沒有注意維生素D的補充，鈣的吸收率可能達不到39%。
維生素D正常情況下是以無活性的骨化醇形式，存在于表皮下，經過紫外線照射激活，再經過肝臟、腎臟兩次酶促反應，形成1,25-二羥維生素D3，這時的維生素D才具有活性，能夠幫助腸道的鈣吸收入血。所以，為促進體內鈣的吸收，日常也要注意多曬太陽，多進行戶外運動。