小腸病變檢查手段不同，檢查步驟也不同。臨床常見檢查手段主要為影像學檢查，包括小腸鋇劑造影檢查、小腸腸系膜血管造影檢查，以及小腸內鏡檢查，如膠囊內鏡檢查，小腸內鏡檢查是檢查小腸疾病相對準確的方法。另外，根據病情還可能進行腹部CT、腹部立位X線平片檢查，以及腹部彩超檢查，必要時還需要進行實驗室檢查。小腸常見的疾病類型，包括感染性疾病、小腸血管性病變和小腸腫瘤等，通過這些檢查措施基本可以發現病變。
一、影像學檢查1、小腸鋇劑造影檢查：小腸鋇劑造影能發現小腸腫瘤、憩室、潰瘍等問題。小腸鋇劑造影檢查創傷性小，能夠發現較明顯的病灶，可用于做腸道相關病變的篩查，必要時再做腸道內鏡檢查；
2、小腸腸系膜血管造影檢查：當患者出現腹痛、腹瀉、便血等，懷疑小腸黏膜血管性疾病時，可做小腸腸系膜血管造影檢查，以發現患者小腸是否伴有血栓等腸壁血液循環不良性疾病；
3、小腸內鏡檢查：小腸內鏡檢查可發現患者是否有腸道出血，或者是出現腸道黏膜破損以及腸道腫瘤等異常病變。患者如出現大便出血，大便形態改變、惡心、嘔吐，都可經小腸內鏡檢查發現病變；
4、腹部CT、腹部立位X線平片檢查：腹部CT檢查能發現感染性、腫瘤性小腸病變，小腸病變通常會有腸壁不規則增厚，腸壁有結節、突起、占位性病變，腸壁與周圍脂肪間隙的變化等，都可以經腹部CT，X線平片檢查發現。腹部立位X線平片檢查，還能發現小腸是否有腸梗阻的情況及病變程度；
5、腹部彩超檢查：腹部彩超檢查能發現小腸是否存在腸道腫瘤、腸梗阻等病變。
二、實驗室檢查包括血常規檢查、大便常規檢查、大便隱血試驗等，能及時發現小腸腸道是否伴有感染性疾病、出血性疾病，可從不同角度支持小腸病變診斷。
上述方法為就醫檢查，患者還可根據自身癥狀進行大致判斷，比如小腸病變的臨床表現一般有發熱、惡心、嘔吐、腹痛、腹瀉、便秘、便血、腹脹、腹部包塊等。如發現上述異常，可結合臨床相關癥狀采取合適的檢查措施，進一步發現小腸病變病因、病位、病變性質和嚴重程度，指導進一步的綜合治療。