心室肌致密化不全可能是以下原因引起的：
1.遺傳因素：兒童的心肌細胞的致密是X連鎖隱性遺傳學)，而成年人則是常染色體顯性遺傳學。而與先天性心臟病相關的心肌組織，則發現了與其相關的基因變異，即在染色體上有一個與其相關的基因。
2.繼發性原因：除其它的先天性心臟病外，還伴有心肌細胞密度不完全。竇狀隙的持續性是指伴有左室或右室的復雜性心臟病，以及先天性的冠心病，從而引起心室肌致密化不全。