治療艾滋病的藥物對梅毒無法起到治療作用，如果是用于艾滋病機會性感染的一些藥物，比如一些抗生素，此時可以治療梅毒。
青霉素類抗生素是梅毒治療的首選藥物，如注射用芐星青霉素、注射用普魯卡因青霉素等，青霉素類抗生素過敏時可選用頭孢曲松鈉制劑，或者四環素類抗生素和紅霉素類抗生素，具體用藥需要聽從醫生指導。
艾滋病目前主要是進行高效抗反轉錄病毒治療，常用藥物包括核苷類反轉錄酶抑制劑、非核苷類反轉錄酶抑制劑、蛋白酶抑制劑、整合酶抑制劑融合抑制劑及CCR5抑制劑，此類藥物無法治療梅毒。
另外，如果是進行免疫調節治療或者使用化療藥物、中藥治療等，都對于梅毒無治療作用。
由于艾滋病患者自身抵抗力較差，容易出現機會性感染，可針對病原菌選擇合適的抗生素進行治療，如果恰好使用了以上治療梅毒的幾種抗生素，才可以一起針對梅毒進行一定的治療。
每一種傳染性疾病的治療方式以及治療藥物存在一定的區別，不建議盲目用藥，需要根據自身具體情況，遵照醫囑使用適當的藥物進行治療。