飛機起飛耳朵不舒服一般是空氣壓力驟然改變，耳內外氣壓失去平衡導致的。
當飛機起飛與下降時，隨著周圍高度的變化，空氣壓力驟然改變，耳道的氣壓是跟周圍壓力一起發生改變，而鼓室內的壓力還來不及調整，耳膜兩邊就產生了壓力差，此時耳內外氣壓失去平衡，從而耳朵不舒服的現象，部分人群會出現耳悶、耳脹、暫時聽力下降等不適癥狀。
咽鼓管功能差的人群可能更容易出現不適，嬰兒和青少年由于咽鼓管還未發育完全，也可能更容易出現不適。此外，上呼吸道感染、鼻塞的人群，此時咽鼓管容易被堵塞，出現不適的現象可能更加嚴重。
如果在坐飛機時耳朵不舒服，可以做促使咽鼓管張開的動作，使耳膜內的壓力可以及早做出調整，比如打呵欠、咽口水、吃東西、喝飲料等，也可以佩戴專用的飛機耳塞，可以自動調節耳內氣壓，使得中耳腔膜內的壓力差可以減緩，讓咽鼓管能發揮正常的功能，消除耳朵疼痛或不適。
坐飛機時要保持舒緩的情緒，避免情緒過于緊張，如果出現較嚴重的不適，例如心跳加速、嘔吐、頭痛等，需要及時報告給工作人員。