如果偶爾吃巧克力，一般不會影響身高，但如果經常吃大量的巧克力，或者本身處于缺鈣狀態，或者存在骨質疏松，這時可能會影響身高。因此日常生活中盡量少吃巧克力，尤其是正處于生長發育階段的青少年，避免影響身高。
巧克力屬于一種高熱量食物，含有豐富的蛋白質、脂肪、糖類等營養成分，日常生活中少量食用巧克力，有助于補充機體所需的部分營養物質，一般不會導致自身長不高。但巧克力中含有部分草酸酯，食用后會與食物中的鈣相結合，降低鈣的吸收率，長期大量食用巧克力可能會降低鈣的吸收。
如果長期食用巧克力，或者處于缺鈣狀態、存在骨質疏松的人群大量食用巧克力，可能會導致鈣質攝入不足，從而影響骨骼中鈣元素的水平，可能會出現缺鈣或者加重缺鈣，甚至有骨質疏松的癥狀，影響正常的生長發育，進而影響身高。部分巧克力中含有較多糖分，過多食用可能會使食用者出現肥胖的情況，甚至誘發高血糖。
日常生活中應當減少食用巧克力等食物，注意清淡飲食，多吃高蛋白、高營養的食物，如雞蛋、牛奶等，補充機體所需要的營養。出現關節疼痛等不適癥狀時，需要及時前往醫院的營養科就診，完善微量元素檢測、血清維生素測定等檢查明確診斷。