支原體肺炎后二個月了還咳嗽可能是氣道高反應性、支氣管炎、肺炎未徹底治愈、咳嗽變異性哮喘、支氣管擴張等因素所致，建議患者及時前往正規醫院就診檢查，在醫生的指導下選擇日常護理、藥物治療或手術治療等方式進行處理。
1、氣道高反應性：支原體肺炎感染后，氣道黏膜受到損傷，即使肺炎已基本痊愈，氣道仍處于較為敏感的狀態。外界輕微的刺激，如冷空氣、粉塵等，就容易引起咳嗽。患者可能在接觸刺激性因素時突然咳嗽，無痰或僅有少量白痰?；颊呖稍卺t生的指導下服用孟魯司特鈉片、氯雷他定片、復方甲氧那明膠囊等藥物進行治療。
2、支氣管炎：支原體肺炎可能導致支氣管黏膜的炎癥持續存在或者再次受到感染引發支氣管炎。炎癥刺激支氣管黏膜，引起咳嗽?；颊呖赡馨橛锌忍?，痰液可能為白色黏液痰或黃色膿性痰，還可能有喘息癥狀。患者可遵醫囑使用阿奇霉素片、鹽酸氨溴索口服溶液、氨茶堿片等藥物進行治療。
3、肺炎未徹底治愈：雖然經過一段時間的治療，但肺炎可能并沒有完全消除炎癥。肺部殘留的炎癥病灶持續刺激肺部組織和神經，導致咳嗽?；颊呖赡馨橛械蜔?、乏力等癥狀?；颊咝枰卺t生的指導下繼續服用抗生素，如左氧氟沙星片、克拉霉素片、頭孢克肟分散片等藥物進行治療。
4、咳嗽變異性哮喘：支原體肺炎可能誘發咳嗽變異性哮喘，尤其是本身具有過敏體質的患者?；颊叩臍獾来嬖诼匝装Y和高反應性，主要表現為刺激性干咳，多在夜間或清晨發作?；颊呖稍卺t生的指導下使用布地奈德福莫特羅吸入粉霧劑（I）、沙美特羅替卡松吸入粉霧劑、硫酸特布他林吸入粉霧劑等藥物進行治療。
5、支氣管擴張：支原體肺炎如果導致支氣管壁結構嚴重破壞，可能發展為支氣管擴張。擴張的支氣管容易積聚痰液，刺激支氣管引起咳嗽，患者可能伴有大量膿痰、咯血等癥狀?；颊呖稍卺t生指導下使用阿莫西林克拉維酸鉀片、鹽酸溴己新片、云南白藥膠囊（咯血時使用）等藥物治療。若病情嚴重，可能需要進行肺葉切除術、支氣管動脈栓塞術等手術治療。
此外，患者要注意避免接觸過敏原和刺激性物質，如花粉、煙霧等。在天氣變化時及時增減衣物，防止著涼。同時，要注意休息，避免過度勞累。飲食方面，應多吃潤肺止咳的食物，如梨、百合等。