碘伏和莫匹羅星一般是能一起用的，不會引起藥物相互反應，還可能促進皮損盡快恢復，建議患者在醫生指導下用藥。
碘伏是消毒防腐的藥物，對多種細菌、芽孢、病毒、真菌等有殺滅作用，莫匹羅星是抗生素類藥物，常用劑型是軟膏，對與皮膚感染有關的各種革蘭陽性球菌有很強的抗菌活性，對耐藥性金黃色葡萄球菌和某些革蘭陰性桿菌也有效。
如果患者出現膿皰病、癤腫、毛囊炎等原發性皮膚感染和濕疹合并感染、潰瘍合并感染、小面積淺表性創傷合并感染等繼發性皮膚感染，以及化膿性皮炎、小面積輕度燒燙傷、小面積皮膚或黏膜損傷等病癥，可以先使用碘伏對皮損進行消毒處理，然后使用莫匹羅星進行殺菌處理，有利于皮損快速修復，縮短皮損的修復時間。
建議患者在用藥期間加強局部皮膚的衛生護理，保持局部皮膚清潔、干燥，避免局部皮膚接觸到污染物和過敏原，避免穿緊身的衣物。同時注意飲食調理，多吃清淡且營養豐富的食物，如雞蛋、牛奶、瘦肉等，增強皮膚的修復能力，促進皮損恢復。