根尖膿腫是急性化膿性根尖周炎的根尖膿腫階段，臨床表現主要有患牙疼痛和松動、咬合食物時疼痛癥狀更重、患牙有浮起感、相應的牙齦部位也會有疼痛癥狀等。
患者會自覺患牙有自發性、劇烈持續的跳動性疼痛，當上下頜牙齒咬合接觸時，患牙的疼痛癥狀會明顯加重。此外，患者會自覺患牙的松動度明顯增大，并且有伸長浮起感。上下頜牙齒咬合時，首先接觸到患牙并且引起劇烈疼痛。進行口腔專科檢查時，可以發現患牙有明顯的叩擊疼痛癥狀，松動度為Ⅰ-Ⅲ度，而且患牙根尖部的牙齦潮紅，觸摸時有輕度的疼痛癥狀。相應部位的表淺淋巴結，比如頜下淋巴結、頦下淋巴結等也會觸及腫大以及疼痛癥狀。
根尖膿腫如果不積極治療，膿腫就會突破牙槽骨，形成骨膜下膿腫，這時患牙的疼痛癥狀會更加劇烈，患者可能感覺到極端痛苦。如果繼續發展，膿腫可能會突破骨膜，形成黏膜下膿腫。這時由于黏膜下組織較疏松，膿液到達黏膜下時，壓力會得到明顯減低，因此，自發性脹痛及咬合痛也隨之減輕。體溫升高、身體乏力等全身癥狀可有所緩解。