甲基異噻唑啉酮對頭發是否有害，通常需要根據產品成分含量進行分析。若該產品成分含量合格，一般無害，若產品中該成分含量超標，或頻繁使用，可能會有一定損害。
甲基異噻唑啉酮是一種有機化合物，也是一種廣譜殺菌防腐劑，主要作用于化妝品中，可以幫助抑制微生物的生長，如抗真菌、霉菌、細菌等，通常在洗發水里會出現甲基異噻唑啉酮的成分，若產品該成分含量合格，正常使用一般不會對頭發或局部皮膚產生損害。
但若產品該成分含量超標，或使用頻繁可能會導致接觸量增加，大量殺滅頭皮各種菌群，使頭皮菌群紊亂，失去正常保護，易對毛囊形成一定的刺激，長期使用可能會引起脫發的現象。因此，不建議長期使用含甲基異噻唑啉酮成分的洗發水。日常生活中需注意正確護理頭發，洗頭發次數避免過勤、水溫避免過高，以免對頭皮及頭發造成損害。