柴胡和黃連均是常用的中藥材，一般情況下，柴胡和黃連一起治療腸炎、胃炎、風熱感冒等疾病。
柴胡性微寒、味苦辛，歸肝、膽、肺經，具有解表退熱、疏肝解郁、升舉陽氣等功效；黃連性寒、味苦，歸心、脾、胃、肝、膽、大腸經，具有清熱燥濕、瀉火解毒等作用。柴胡和黃連中均含有天然的抗菌成分，尤其是生物堿、小檗堿以及酚類化合物的含量均比較高，可以抑制人體內病毒的活性，起到抗菌消炎的作用，因此柴胡和黃連能夠一起治療腸炎、胃炎、氣管炎等疾病。柴胡和黃連在一起，還可以促進胃腸黏膜再生，能讓潰瘍面盡快愈合，緩解胃潰瘍和十二指腸潰瘍引發的腹痛癥狀。此外，柴胡可以疏風清熱、解表散寒，而黃連可以清熱去火，二者能抑制流感病毒的活性，還能加快人體的熱毒排出，用于治療風熱感冒、流行性感冒等疾病。