在臨床上，鼻腔通常能用棉簽進去3cm左右，但具體深度因人而異，不可一概而論。在使用棉簽清理鼻腔時，一定要注意把握深度和力度，以免導致不良后果的發生。
通過使用棉簽，能夠幫助清理鼻腔內的鼻涕等分泌物，達到清潔鼻腔的效果。但是在平時使用棉簽清理鼻腔時需要注意深度，一般保持3cm左右即可，如果為嬰幼兒，則棉簽進去的長度需要適當縮短，否則操作不當的情況下，可能會造成鼻腔黏膜的損傷。此外，使用棉簽清理時不宜力度過大，否則容易造成鼻腔黏膜損傷，甚至會造成鼻腔出血。
通常情況下，鼻腔內的少量分泌物跟隨著纖毛的擺動，能夠自動向外移動而排出。針對鼻腔分泌物過多的情況，可以適當使用棉簽進行清理，但不可經常使用棉簽清理鼻腔，以免造成鼻腔黏膜破裂或誘發鼻腔感染。必要時，可以適當遵醫囑使用生理氯化鈉溶液清洗鼻腔，有助于部分分泌物的排出。