做完腸息肉術后菌群有可能會造成破壞，但是會隨著自身的代謝逐漸的恢復，另外也可以通過藥物的方法進行調整。
在手術過程中很可能會導致腸道功能受到影響，甚至還會導致出現腸道菌群失調，一般是可以自行恢復的，必要時可以在醫生指導下使用益生菌調理，能夠達到調節腸道菌群失調的效果，也能夠縮短恢復的時間。
在日常生活中還需要注意好飲食調整，飲食上盡量以流食或者是半流食為主，不要進食油膩性或者是辛辣刺激性食物，以免增加胃腸道負擔。