麝香具有多種藥理作用，但使用不當時也可能產生一些副作用，比如刺激腸胃、過敏反應、神經中樞系統抑制、心律失常、肌肉震顫。
1.刺激腸胃：麝香對腸道黏膜具有一定的刺激性，大量使用可能導致惡心、嘔吐、食欲減退，甚至出現吐血、便血等癥狀。
2.過敏反應：對于體質敏感的人，使用麝香后可能引發過敏反應，如皮膚紅斑、丘疹，并伴有明顯的皮膚瘙癢。嚴重的過敏反應可能導致口唇發白、呼吸急促，甚至休克。
3.神經中樞系統抑制：麝香中的某些化學成分可能對神經細胞產生毒性作用，導致神經傳遞功能障礙，進而引發意識模糊、嗜睡甚至昏迷等癥狀，嚴重時可能危及生命。
4.心律失常：麝香可能影響心肌細胞膜的電位，導致心臟電信號傳導紊亂，引發心悸、胸悶等癥狀，長期存在可能增加心血管疾病的風險。
5.肌肉震顫：麝香可能影響神經-肌肉接頭處的信號傳遞，導致肌肉不自主抽搐，長時間未緩解可能影響日常生活和工作能力。
此外，孕婦應遠離麝香，可能增加流產的風險，這與其活血化瘀的功效有關，具有陽盛陰虛或血虛盜汗癥狀的患者也不宜使用麝香。