聯邦阿莫西林和普通阿莫西林成分基本上相同，只是生產廠家不同而已，但由于生產廠家的不同，可能藥物的原料純度不同，進而可能會導致藥效存在細微差別。聯邦阿莫西林的價格要更貴一些，因為使用的原料純度可能更高，這就導致其藥品的純度可能要比普通阿莫西林高。此外，不同生產廠家的制作工藝不同，也可能導致藥效有所差異，其不良反應發生率也可能有所差別。
但不論如何，兩者均歸屬于阿莫西林類抗生素，阿莫西林適用于敏感細菌引起的感染，例如溶血鏈球菌、肺炎鏈球菌、葡萄球菌或流感嗜血桿菌所致中耳炎、鼻竇炎、咽炎、扁桃體炎等上呼吸道感染，還有大腸埃希菌、奇異變形桿菌或糞腸球菌所致的泌尿生殖道感染等。阿莫西林還可以與克拉霉素和蘭索拉唑聯合使用，根除胃和十二指腸中的幽門螺桿菌，降低消化性潰瘍的復發率。
此外，阿莫西林服用后可能會引起惡心、嘔吐、腹瀉等胃腸道不良反應，或者皮疹、藥物發熱和哮喘等過敏反應，以及貧血、血小板減少、嗜酸性粒細胞增多等，偶爾可見興奮、焦慮、失眠、頭暈等中樞神經系統的癥狀，不良反應嚴重時，需在醫生指導下停止服用藥物。