扁桃體發炎后一直頭疼，比較常見的有神經性頭疼和炎癥性頭疼。發病以后，需要及時到耳鼻喉科、神經內科就診，做血常規檢測、間接喉鏡檢查，有助于判斷病情然后進行針對性的治療。
1、神經性頭疼：扁桃體發炎主要是因為細菌感染發炎導致的，如果炎癥反應比較重，會引起頭面部神經牽涉性頭疼。可以在醫生指導下選擇藥物治療，比較常用的是營養神經藥物如甲鈷胺片。如果疼痛比較重可以配合口服止痛藥物對癥治療如布洛芬緩釋膠囊等，但是用藥時間不宜過長，需要定期復查，觀察治療效果；
2、炎性頭痛：因為扁桃體發炎引起鼻腔鼻竇炎癥，導致炎性分泌物潴留，引起炎癥性頭痛，需要遵醫囑用抗生素藥物進行抗炎治療，比較常用的是頭孢類或青霉素類藥物，比如阿莫西林膠囊、頭孢丙烯分散片等。如果炎性分泌物比較多，可以配合口服黏液促排劑，比如歐龍馬滴劑或桉檸蒎腸溶軟膠囊，炎癥反應逐步減輕以后，頭痛癥狀也會隨之緩解。