核酸檢測Ct值是指循環閾值，參考數值為35，高于35為陰性，低于35為陽性。核酸檢測指利用聚合酶鏈式反應，即PCR，放大擴增特定的核酸片段，具有較高的敏感性、特異性。
核酸檢測常用于檢測微量核酸，完整的反應步驟稱為循環，循環次數越多，核酸被放大倍率也就越高。Ct值是核酸擴增到檢測閾值時所經歷的循環數，核酸與Ct值存在線性關系，即起始拷貝數越多Ct值越小，起始拷貝數越少Ct值越大。
用于病毒檢測時，Ct值可以理解成未被量化的病毒載量，Ct值越低表明病毒載量越高，如果具有傳染性，通常也意味著傳染性更小。如果沒有Ct值，或者Ct值很高，則意味著樣本中沒有檢出病毒核酸，或者沒有達到檢測下限，也就是說Ct值的數值與病毒含量、傳染力成反比，Ct值越高，越安全。進行核酸檢測時，一般會采取咽拭子，需要規范采集標本，避免采集樣本被污染，否則誤診幾率比較高，不利于疾病判斷。
