灌腸的目的為幫助糞便在體內注意事項排出，注意事項通常包括動作要輕、分清是藥物灌腸還是清潔灌腸等，否則會危害患者身體健康。
灌腸的主要目的是清潔胃腸道，通過灌腸刺激胃腸道蠕動，從而排出腸腔內的糞便，還可以幫助患病的患者解決大便困難的癥狀。
患者可以在醫生指導下進行灌腸，注意事項通常包括動作要輕柔、肛管進入直腸后不能使用暴力，否則會導致腸穿孔，引起較為嚴重的并發癥。另外灌腸的高度一定要高，否則沒有水的壓力無法進入腸道，無法完成該操作。患者在進行灌腸時要分清楚是藥物灌腸還是清潔灌腸，兩者之間注意事項有所區別，所以患者要咨詢清楚。
患者應該嚴格避免自行灌腸治療，如果灌腸方法不當，會導致肛周及直腸黏膜受到損傷。