5個月嬰兒兩只腳老是互相搓可能是生理反應、毛囊炎、過敏等原因引起的，需要根據具體的病因進行治療，具體分析如下：
1.生理反應：5個月嬰兒的神經正在快速發育，神經的豐富會促使嬰兒出現肢體的活動，如手部晃動、兩只腳老是互相搓等，這是正常的生理現象，并不會對嬰兒身體的健康造成影響，家長不必過于擔心。
2.毛囊炎：如果嬰兒的腳部護理不恰當，出現了細菌或者真菌感染，可能會引起了毛囊炎，導致嬰兒的腳部瘙癢感，出現兩只腳老是互相搓的現象。這種情況下，建議家長要注意嬰兒的衛生，也可以在醫生的指導下使用莫匹羅星軟膏、夫西地酸鈉軟膏、紅霉素軟膏等藥物進行治療。
3.過敏：如果嬰兒接觸到過敏原，腳部出現了過敏反應，可能會導致嬰兒的腳出現紅腫、瘙癢等癥狀，從而引起兩只腳互相搓。這種情況下，家長可以在醫生的指導下給嬰兒使用丁酸氫化可的松乳膏、爐甘石洗劑、氧化鋅軟膏等藥物進行治療。