通常情況下，懷孕四十天是否可以藥物處理，還需要根據實際情況來判斷，如果診斷為宮內受孕是可以通過藥物處理的，但如果是異位妊娠還需要根據具體的情況來分析是否可以藥物處理。具體分析如下：
1.宮內受孕：宮內受孕指的是受精卵著床在子宮腔當中，如果通過腹部彩超檢查確定是宮內受孕，并且懷孕沒有超過四十九天，是可以通過藥物來處理的，一般需要在醫生的指導下服用米非司酮片、米索前列醇片等藥物來治療，可以促進子宮收縮，從而幫助孕囊盡快的排出。
2.異位妊娠：異位妊娠指的是受精卵沒有在子宮腔當中，而是在其他部位著床，如果異位妊娠的孕囊小于二厘米以下，一般是可以藥物處理的。但如果出現了腹部疼痛以及陰道不規則出血等癥狀之后，不可以做藥物處理，可以在醫生的指導下選擇輸卵管妊娠保守性手術來治療。