臨床中，不能單純依據孕囊扁長判斷發育好不好，通常醫生需要結合孕周，以及是否出現胎芽、胎心，和孕囊張力情況，以及HCG、孕酮等進行綜合判斷。
一般孕5周后，孕囊大小為0.4-0.7cm，孕6周可以達到1cm。如果孕囊張力較低，位置靠近宮頸，無論形態是橢圓形，還是正圓形，都提示胎兒發育不好。此外，如果檢查HCG，48小時后復查沒有出現翻倍或HCG水平降低，同時孕酮、雌激素水平也較低，也可能存在胎兒發育不好。但如果孕7周，B超檢查發現胎芽，以及有胎心管搏動，提示胎兒發育正常，孕婦不用過于擔心。
孕囊只是作為判斷胎兒發育的一個輔助指標，僅是孕囊扁長一般不會有較大的影響，隨著胎兒的繼續生長，會趨向于正常狀態。此外，孕囊可能受外力的作用發生形態變化，如孕婦進行檢查時醫生按壓力度較大等，所以建議孕婦保持良好的心態，并攝入充足的營養，為胎兒發育提供支持。