上頜骨囊腫有可能發生癌變。上頜骨囊腫屬于一種良性病變，一般情況下不會發生癌變，但是上頜骨囊腫反復發作，或是反復受到感染出現炎癥反應后，便可能會發生癌變。
上頜骨囊腫是指在頜骨內出現肉芽增生或含有液體腫物的現象，如果盡快前往正規醫院通過X光線檢查確診，并進行根管治療或手術治療去除囊腫，一般不會癌變。但如果不及時治療，上頜骨囊腫會逐漸增大，壓迫牙槽骨、牙根，出現面部畸形、牙齒疼痛，甚至松動的現象。當囊腫破裂時，便會引起繼發性感染，治療不徹底使上頜骨囊腫反復，增加癌變的風險。
出現上頜骨囊腫時應及時治療，日常生活中盡量進食軟質食物，避免對上頜骨囊腫進行刺激。如果懷疑上頜骨囊腫發生癌變，可及時前往醫院，進行病理組織學檢查進行鑒別。