百會穴的位置通常為前發際正中直上5寸，通常可以主治神志病癥、頭面病癥、氣機下陷引起的臟器脫垂等病癥，建議患者配合醫生進行治療。
百會穴通常位于腦后七寸的地方。百會穴的簡單取穴法為兩耳尖連線與頭頂中心線相交之處。百會穴通常可以起到醒腦開竅、升陽舉陷等作用，適用于神志不清、頭面五官病證、氣失固攝等病癥，還可以輔助治療癡呆、中風、失語、失眠、驚悸、健忘、頭痛、眩暈、耳鳴、脫肛、陰挺、泄瀉、遺尿、胃下垂等癥狀。
在臨床應用中，百會穴多與其他穴位合用，以提高療效。如果需要治療腦卒中語言障礙，患者可以針灸百會穴、風蹺穴。如果需要治療癲狂，患者可以配合醫生針灸百會穴、神門穴、陽溪穴等。