腺樣囊性癌比較嚴重，具有腺上皮、肌上皮細胞雙相分化的特點，并且病程緩慢，但長期預后不佳。出現腺樣囊性癌，應該盡早進行治療。
腺樣囊性癌比較嚴重是因為其有一定的特征性，其自然病程較長，發展較為緩慢，且腫瘤極易侵犯神經，容易大面積擴散，并且有較強的侵襲性，與周圍組織無界限，肉眼不能直接觀察到組織異常。腺樣囊性癌還具有嗜骨性，容易侵犯骨骼，進入骨髓腔后沿著骨髓腔浸潤，常為散在的細胞團，且在X線上沒有明顯的骨質破壞，難以診斷是否有骨轉移。此外，腺樣囊性癌可沿骨膜擴展，侵入血管，造成血行性轉移，轉移率較高，以肺部轉移最常見，如果出現多系統轉移，會極大影響患者的生存期。
臨床上根治性手術切除聯合術后放療，是常用的治療腺樣囊性癌的方案，全身化療對于腺樣囊性癌通常沒有明顯作用，對于有癥狀的轉移性疾病或復發性疾病或不適合手術的快速進展的患者，化療可作為姑息性的治療手段。因此，腺樣囊性癌具有難發現、易轉移、難治療、預后差等特點，屬于比較嚴重的疾病。